חרף יכולתנו הבלתי נתפסת לחדור למעמקי הגנום של צמחים ולהפיק ממנו מידע על ההיסטוריה של עולם הצומח, שאלות רבות נותרו ללא מענה, וזאת מכמה סיבות.
ראשית, אף שאנו מכירים היטב את מרבית מיני הצומח בעולם, בזכות מסעות מחקר ואיסוף של צמחים גם מהמקומות הנידחים ביותר בעולם, עדיין חסר ידע תיאורי על רבים ממינים אלה, ולו משום שמספר הבוטנאים העוסקים בכך קטן עשרות מונים ממספר המינים הממתינים לתיאור מעמיק. וללא תיאור מעמיק, איכותני וכמותי, חסרים נתונים המשקפים נאמנה את עולם הצומח.
שנית, מאובני צמחים אינם נפוצים ביותר, והידע על התפתחות מבנה הצמח לאורך מיליוני דורות מוגבל מאוד בגלל המחסור בנתונים.
ושלישית, יש גישות רבות לפירוש הנתונים שנאספו. ויכוחים מרים ניטשים על הדרך הנכונה לנתח את הידע על הביולוגיה המולקולרית של צמחים ועל שילוב ממד הזמן בתיאור הוליסטי של עולם הצמחים.